Wenn es im Winter frostig wird, kann es zu Schwierigkeiten bei der Leerung der Biotonnen kommen. Es reichen schon Temperaturen knapp unter dem Gefrierpunkt aus, dass feuchte Abfälle an den Innenwänden oder am Boden der Biotonne festfrieren.
Damit es nicht zur Eiszeit in der Biotonne kommt, empfiehlt es sich, feuchte oder matschige Küchenabfälle wie Kaffeeprütt und Obstreste in Zeitungspapier gewickelt in die Biotonne zu geben. Nach der Leerung kann die Biotonne mit einigen Lagen Zeitungspapier auf dem Boden und an den Innenwänden gegen das Anfrieren von Biogut ausgerüstet werden. Abfälle frieren weniger leicht fest, wenn sie locker in den Behälter gegeben werden. Deshalb ist es in den kalten Zeiten ganz besonders wichtig, den Müll niemals in die Tonnen zu pressen.
Ein witterungsgeschützter Standplatz für die Biotonne verringert ebenfalls die Gefahr des Festfrierens von organischen Abfällen.